Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CHORDC1Q9UHD1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms