Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GIN1Q9NXP7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GIN1Q9NXP7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms