Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
APOBEC3GQ9HC16 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms