Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCDC106Q9BWC9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC106Q9BWC9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms