Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EBF4Q9BQW3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EBF4Q9BQW3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms