Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
BEST4Q8NFU0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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