Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDPD3Q7L5L3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDPD3Q7L5L3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GDPD3Q7L5L3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDPD3Q7L5L3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDPD3Q7L5L3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GDPD3Q7L5L3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GDPD3Q7L5L3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDPD3Q7L5L3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDPD3Q7L5L3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDPD3Q7L5L3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GDPD3Q7L5L3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GDPD3Q7L5L3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GDPD3Q7L5L3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GDPD3Q7L5L3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GDPD3Q7L5L3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.05■□□□□ 0
GDPD3Q7L5L3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GDPD3Q7L5L3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GDPD3Q7L5L3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GDPD3Q7L5L3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms