Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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