Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCNIQ14094 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCNIQ14094 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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