Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IFT88Q13099 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IFT88Q13099 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
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