Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM4P49221 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM4P49221 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM4P49221 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM4P49221 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM4P49221 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM4P49221 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM4P49221 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM4P49221 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM4P49221 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM4P49221 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TGM4P49221 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TGM4P49221 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TGM4P49221 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms