Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GDF5P43026 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDF5P43026 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDF5P43026 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDF5P43026 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDF5P43026 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDF5P43026 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDF5P43026 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDF5P43026 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDF5P43026 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDF5P43026 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDF5P43026 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDF5P43026 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GDF5P43026 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF5P43026 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF5P43026 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms