Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PLNP26678 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PLNP26678 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms