Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CFAP73A6NFT4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms