Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTPS2Q9NRF8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms