Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SFXN2Q96NB2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SFXN2Q96NB2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms