Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LETMD1Q6P1Q0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETMD1Q6P1Q0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms