Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GBX1Q14549 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GBX1Q14549 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms