Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MRPL28Q13084 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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