Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
EFNA1P20827 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EFNA1P20827 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms