Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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KDM4BO94953 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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KDM4BO94953 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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KDM4BO94953 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KDM4BO94953 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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