Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLN6Q9NWW5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms