Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SMIM3Q9BZL3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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