Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
YTHDC1Q96MU7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
YTHDC1Q96MU7 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms