Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PROX1Q92786 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms