Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYKP34925 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYKP34925 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYKP34925 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYKP34925 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYKP34925 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYKP34925 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYKP34925 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYKP34925 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYKP34925 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYKP34925 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RYKP34925 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RYKP34925 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RYKP34925 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RYKP34925 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RYKP34925 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RYKP34925 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RYKP34925 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RYKP34925 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RYKP34925 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYKP34925 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYKP34925 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYKP34925 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYKP34925 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RYKP34925 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYKP34925 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYKP34925 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYKP34925 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYKP34925 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYKP34925 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYKP34925 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYKP34925 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYKP34925 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYKP34925 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYKP34925 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYKP34925 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYKP34925 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYKP34925 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYKP34925 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RYKP34925 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms