Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HLA-DMAP28067 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms