Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNL1Q9UK58 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCNL1Q9UK58 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCNL1Q9UK58 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCNL1Q9UK58 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCNL1Q9UK58 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCNL1Q9UK58 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNL1Q9UK58 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNL1Q9UK58 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNL1Q9UK58 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNL1Q9UK58 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNL1Q9UK58 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNL1Q9UK58 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNL1Q9UK58 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNL1Q9UK58 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNL1Q9UK58 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNL1Q9UK58 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNL1Q9UK58 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNL1Q9UK58 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNL1Q9UK58 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNL1Q9UK58 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms