Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC71Q8IV32 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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