Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IMPG1Q17R60 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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