Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RTN1Q16799 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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