Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SMCO1Q147U7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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