Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DHX9Q08211 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms