Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NHLH2Q02577 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms