Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBASH3AP57075 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms