Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARFIP1P53367 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms