Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HLA-DMAP28067 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms