Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGA2P17301 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms