Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms