Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B0

CTDP1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1Q9Y5B0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTDP1Q9Y5B0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTDP1Q9Y5B0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CTDP1Q9Y5B0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CTDP1Q9Y5B0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTDP1Q9Y5B0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms