Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMED5Q9Y3A6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMED5Q9Y3A6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED5Q9Y3A6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms