Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHKBQ9Y259 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHKBQ9Y259 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHKBQ9Y259 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms