Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCE1Q9Y256 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCE1Q9Y256 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RCE1Q9Y256 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RCE1Q9Y256 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms