Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GINS2Q9Y248 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GINS2Q9Y248 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GINS2Q9Y248 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GINS2Q9Y248 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms