Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPA5

BSN, Protein bassoon, humanhuman

Predictions only

Length 3,926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSNQ9UPA5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BSNQ9UPA5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BSNQ9UPA5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BSNQ9UPA5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BSNQ9UPA5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BSNQ9UPA5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BSNQ9UPA5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BSNQ9UPA5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BSNQ9UPA5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BSNQ9UPA5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BSNQ9UPA5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BSNQ9UPA5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms