Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXL4Q9UKA2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXL4Q9UKA2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXL4Q9UKA2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms