Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNTNAP2Q9UHC6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CNTNAP2Q9UHC6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CNTNAP2Q9UHC6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms