Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL3Q9UH77 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL3Q9UH77 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms