Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGK8

SERGEF, Secretion-regulating guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERGEFQ9UGK8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SERGEFQ9UGK8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SERGEFQ9UGK8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SERGEFQ9UGK8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERGEFQ9UGK8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SERGEFQ9UGK8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms