Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ABCF2Q9UG63 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ABCF2Q9UG63 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ABCF2Q9UG63 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162 ms